| Fermented foods | Unfermented foods | Total/ % | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Species (number of isolates) | E. faecium (20) | E. faecalis (62) | Other spp. (6) | Total/ % 88/ (100Â %) | E. faecium (34) | E. faecalis (24) | Other spp. (19) | Total/ % 77/ (100Â %) | (165)/ 100Â % |
Virulence factors* | |||||||||
  Ace | 9 | 49 | 1 | 59/ (67 %) a | 1 | 21 | 1 | 23/ (29 %) b | 82/ (49 %) |
  Agg | 4 | 31 | 2 | 37/ (42 %) a | 0 | 14 | 2 | 16/ (21 %) b | 53/ (32 %) |
  Ccf | 9 | 52 | 1 | 62/ (70 %) a | 19 | 23 | 2 | 44/ (57 %) a | 106/ (64 %) |
  Cpd | 6 | 46 | 1 | 53/ (60 %) a | 13 | 21 | 1 | 35/ 45 %) a | 88/ (53 %) |
  efaAm fm | 16 | 8 | 3 | 27/ (31 %) b | 34 | 4 | 3 | 41/ (53 %) a | 68/ (41 %) |
  Esp | 3 | 33 | 0 | 36/ (41 %) a | 0 | 12 | 1 | 13/ (17 %) b | 49/ (30 %) |
  GelE | 11 | 27 | 3 | 41/ (47 %) a | 12 | 19 | 4 | 35/ (45 %) a | 76/ (36 %) |
Antibiotics** | |||||||||
 Am | 0 | 0 | 0 | 0/ (0 %) | 0 | 0 | 0 | 0/ (0 %) | 0/ (0 %) |
 C | 2 | 6 | 0 | 8/ (9 %) a | 0 | 0 | 1 | 1/ (1 %) b | 9/ (5 %) |
 Cc | 10 | 44 | 6 | 60/ (68 %) b | 26 | 20 | 18 | 64/ (83 %) a | 124/ (75 %) |
 Cip | 13 | 3 | 1 | 17/ (19 %) b | 15 | 7 | 8 | 30/ (39 %) a | 43/ (26 %) |
 E | 9 | 15 | 0 | 24/ (27 %) a | 3 | 10 | 1 | 14/ (18 %) a | 38/ (23 %) |
 N | 10 | 53 | 5 | 68/ (77 %) a | 21 | 20 | 11 | 52/ (68 %) a | 120/ (72 %) |
 Ra | 5 | 5 | 0 | 10/ (11 %) a | 6 | 1 | 7 | 14/ (18 %) a | 24/ (15 %) |
 P | 3 | 7 | 1 | 11/ (13 %) b | 21 | 4 | 10 | 35/ (45 %) a | 46/ (28 %) |
 Te | 4 | 26 | 5 | 35/ (40 %) a | 11 | 20 | 1 | 32/ (41 %) a | 67/ (40 %) |
 Va | 0 | 1 | 0 | 1/ (1 %) a | 0 | 1 | 0 | 1/ (1 %) a | 2/ (1 %) |